Avec le choix de 43 Îles intérieures, la variété est l'ordre du jour. Toutes ces Îles nordiques offrent des récifs granitiques impressionnants, où les roches sculptées peuvent être couvertes de coraux et d'éponges molles, permettant une vie marine active et prolifique, en raison de l'isolement de l'archipel, mais également grâce à ses règles de conservation strictes.
Les plongées dans les épaves sont possibles dans quelques secteurs bien définis, mais seules les Îles aux sud permettent des plongées le long des falaises sous-marines, des plongées de descente et de dérive au fil de l’eau.
La plongée aux abords des Îles extérieures constitue une expérience inédite avec l’exploration de ses grottes et canyons, habités par des Raies Mantra en migration, de nombreux emplacements d'épaves et certains spécimens de Gorgones les plus remarquables de l'Océan Indien.
La plongée aux abords des falaises d'Aldabra est fabuleuse et on peut apercevoir les tortues vertes dans l'eau ou se dirigeant vers la plage pour pondre leurs œufs et nicher.
L'atoll de Cosmoledo offre un corail dur investi d’énormes Gorgones avec des polypes de 3 mètres de massive éponge en forme de tonneau, sous le regard attentif et inquisiteur des pastenagues.
Le récif d’Astove est une autre source d’inspiration pour les plongeurs avec un tombant descendant pic, dont le récif est incisé de crevasses et des cavernes, où ont élu domicile les tortues vertes. Les profondeurs de plongée sont variables, s'étendant de 8 à 20 mètres de profondeur pour les emplacements côtiers et jusqu'à 40 mètres pour les plongées en mer.