La vie marine des Îles intérieures regorge d’une abondance de poissons même sur les récifs côtiers peu profonds, qui abritent différents types de poissons tels que des poissons Papillon, des Scalaires, des Rougets, des Merluches et des Sweepers parmi tant d’autres. Les récifs des 'Îles sont également de magnifiques asiles pour beaucoup d'invertébrés comprenant le poulpe, la langouste et une pléthore de Nudibranches, tel que le pageot acarné.
Les sites qui bénéficient de courants réguliers abritent des coraux en éventail et une myriade de formations d’arbres coralliens éblouissantes, alors que les sites les plus éloignés abritent les plus grandes espèces de poissons, telles que la girelle impériale, le mérou géant, les requins des récif et le bar tacheté. Les plus spectaculaires de tous, sont les requins baleine s’alimentant de plancton, aux abords des Îles intérieures tout au long de l’année, avec des pics maximaux en août, et d’octobre à janvier.
La vie marine autour des Îles extérieures dont la situation isolée permet une meilleure prolificité, permet la présence de plusieurs des espèces, en particulier le mérou géant, le requin gris des récifs, le pastenague, le bar tacheté, le requin nourrice et le requin océanique. Un certain nombre de poissons rares exotiques ont été régulièrement identifiés dans les profondeurs d’Astove, tels que le scalaire nain Africain, qu’on pensait trouver uniquement au large de l’Île Maurice. Des Yellow Rubber Lipped Sweetlip, comme des elusive Long-Nosed Hawkfish, peuvent être facilement aperçus dans la plupart des secteurs où prolifèrent les Gorgones.
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